十二指腸球炎的治療主要分為非藥物治療和藥物治療。在非藥物治療方面，主要是要勞逸結合，不要太過勞累、不要熬夜，要戒煙、戒酒，不要吃刺激胃腸的食物。
在藥物治療方面，主要是保護胃黏膜，如果膠鉍或者枸櫞酸鉍、還有鋁碳酸鎂，這些都可以起到保護胃黏膜的作用;其次，是抑酸的藥物，如H2受體拮抗劑、法莫替丁、雷尼替丁，或者是質子泵抑制劑，如奧美拉唑、埃索美拉唑。
其它沒有特殊的治療，主要是長期調節自己的生活和飲食，調整好以后愈合會比較快。藥物治療不作為最主要的治療。建議患者到正規的醫院就診，根據醫生開具的處方進行系統的治療和服藥。
